忍者军是个独立于军部和内政部之外的部门，类似单独的京都组。

对内也很神秘，很多人都只知道一些基本信息。

比如，军团长是服部半藏。

世濑藏人，石川五右卫门，高坂甚内是副军团长，各带领一支忍者队伍。

内部分工也不同，主要从事几大方面的工作：情报收集，刺杀破坏，拉拢策反，人员监察等。

摊子越来越大了，李义也有意让情报部门开始隐入暗处。

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内政部下辖：

财政局，局长大久保长安（部将）

工业局，局长芝辻清右卫门（家老）

卫生局，局长施药院全宗（侍大将），副局长曲直濑玄朔（侍大将）

商业局，局长濑户方久（侍大将）

交通局，局长大浦为则（部将）

农业局，局长安井道顿（侍大将）

林业局，局长大谷休泊（侍大将）

水利局，局长增田长盛（侍大将）

治安局，局长大浦守信（家老）

李义给财政局的任务是探挖金矿，开展金融业务，逐渐发行自己的货币。

给工业局的任务是快速打造更多的火枪火炮，同时开始研究更先进的加农炮和燧发枪。

卫生局主要是防疫，疾病治疗，老年天团的定期检查，还有大力发展研究行军打仗时的战场急救。

商业局是赚钱，赚钱，赚钱，开设商铺啊，贩卖交易啊，还是远洋贸易啊，随意，只要赚钱。

交通局则是负责铺路，宗旨就是村村通土路，官道则大马路。因为需要发动本地村民们出劳役，所以大埔为则走马上任。

农业局李义的指示是大力发展沟渠灌溉，开荒种田，不断优化粮食种类和品种，快速提高粮食产量。

林业局工作相对简单，主要是负责植树和砍树，还有帮着制造各种器械。

水利局主要负责码头，领地内的河水治理，水利设施的修建，河道的拓宽，协助交通局组建领地内水路交通网。

治安局的任务很重，既要收缴所有领地内村民武器，又要保证地方治安。所以直接让老仆大浦守信做了第一任公安局长。

而除了以上所有部门外，还有个最核心的部门。

那就是李义的指挥部。

指挥部：

家主，足利义氏殿下。

军师，本多正信（部将），参谋全局，对口负责内政部。

军师，竹中半兵卫（部将），参谋全局，对口负责亲卫军和野战军。

军师，黑田官兵卫（部将），参谋全局，对口负责金龙军和对接后勤保障。

长老，武田信虎（家老），参谋全局，兼汉城城主。

长老，上泉秀纲（家老），参谋军部，对口军队训练。

长老，塚原卜传（家老），参谋军部，对口军队训练。

指挥部对所有事务有指挥之权。

所有主官必须侍大将以上职位担任。