在成功消灭“暗影”组织的核心领导层后，联合小队和宇宙联盟迎来了短暂的喘息之机。然而，他们深知“暗影”组织的根基深厚，绝不会轻易被彻底击败。

联合小队没有丝毫懈怠，他们马不停蹄地对“暗影”组织的残余势力展开了清剿行动。在各个星系之间穿梭，不放过任何一个可能隐藏着“暗影”成员的角落。

与此同时，宇宙联盟也在积极进行战后的重建和安抚工作。那些曾经被“暗影”组织蛊惑或控制的星系，需要重新建立起对联盟的信任和秩序。

“我们不仅要消灭敌人，还要让这片宇宙重新焕发生机。”联合小队的队长在一次会议上说道。

在一个曾经饱受“暗影”组织摧残的星球上，联合小队帮助当地居民修复被破坏的城市，重建基础设施。队员们与居民们一起劳动，汗水洒落在土地上，希望的种子也在一点点生根发芽。

“谢谢你们，让我们重新看到了生活的希望。”一位老人眼中含着泪花说道。

而在另一个星系，联合小队的科学家们正在研究“暗影”组织所使用的科技，试图从中找到防范类似威胁再次出现的方法。

“他们的科技中蕴含着危险的理念，但如果我们能加以正确引导和利用，也可以为宇宙的发展做出贡献。”

经过一段时间的努力，“暗影”组织的残余势力逐渐被压缩到了宇宙的边缘地带，他们的活动范围越来越小，影响力也越来越弱。

然而，就在大家都以为胜利在望的时候，“暗影”组织发起了一次疯狂的反扑。他们集结了最后的力量，对宇宙联盟的重要据点发动了突然袭击。

“全体戒备，准备战斗！”警报声在各个基地响起。

联合小队迅速响应，与“暗影”组织展开了激烈的交锋。战火再次燃烧，星空被能量的光芒照亮。