赵姬怀孕后搬离秦宫，前往雍地生下孩子，并在之后数年一直与嫪毐同住。

秦王政八年（前239年），嫪毐因平定成蟜叛乱有功，受封长信侯，赵姬身边的大小事甚至朝廷大事都由他决定。

嫪毐的野心也随之膨胀，积极培植私人势力，家中童仆众多，前来投奔他为舍人的宾客也多达千余人。

秦王政九年（前238年），有人向秦王密告嫪毐与太后赵姬淫乱，并预谋叛乱让私生子继位。

秦王下令彻查，嫪毐决定先下手为强，伪造赵姬印信，调动士卒攻打秦王居所蕲年宫，史称“蕲年宫之变”。

叛乱很快被平定，嫪毐被处以车裂之刑，并夷三族，嬴政同母异父的两个弟弟也被处死。

赵姬受到牵连，被幽禁于雍地行宫。

朝中不少大臣为赵姬求情，嬴政却执意要和她断绝关系，甚至处死了二十七位进谏者。

这时齐国人茅焦劝说道，秦国目前最重要的事是统一大业，若秦王幽禁母亲，会使声名受损，恐怕天下诸侯听闻后，愈加不信服秦国。

嬴政最终被劝服，厚葬被杀的大臣，准备隆重的车队，亲自前往雍地迎回赵姬，赵姬得以重新回到甘泉宫居住，安享晚年。

秦王政十九年（公元前228年），赵姬逝世，死后被追封为帝太后，与秦庄襄王合葬于茝阳（又作芷阳，今陕西省西安市东北）。

关于秦始皇嬴政的生父究竟是谁，历史上存在一定争议。

司马迁在《史记·吕不韦列传》中记载赵姬在被献给异人之前就怀了吕不韦的孩子，只是隐瞒了身孕。